西日本電信電話株式会社、国立研究開発法人理化学研究所、国立大学法人福島大学、国立大学法人北海道大学、国立大学法人東京大学大学院農学生命科学研究科、株式会社前川総合研究所、地方独立行政法人大阪府立環境農林水産総合研究所、国立大学法人筑波大学の8組織は、1.農業の自然循環機能の増進、2.環境負荷の低減、3.生物多様性の保全に配慮したネイチャーポジティブな環境再生型農業の普及拡大をめざし、「果樹の農業生態系の各層（土壌及び微生物叢、作物）のデジタルデータ化及びマルチオミクス解析」に関する共同研究を行います。

なお、得られたデジタルデータは、NTTが提唱するIOWN構想の最先端テクノロジーと組み合わせ、農業のデジタルツインコンピューティングをめざします。

植物－微生物共生研究開発チーム市橋泰範チームリーダーは本研究メンバーの一人です。